远在两千多年前，我国即有了灵芝崇拜，并伴之以许多美丽的神话故事。把灵芝称为“瑞草”或“瑞芝”。他们把灵芝菌盖表面的许多环形轮纹称做“瑞征”或“庆云”，视为“祥瑞”、“吉祥如意”的象征，形成了中华文化中特有的灵芝崇拜。
战国时代，《山海经》中就有炎帝之女瑶姬不幸夭折化为瑶草的故事。楚国诗人宋玉在《高唐赋》中更将其夸张为人神相恋的爱情故事，其中的“巫山神女”即为瑶姬。以至后人有“帝之季女，名曰瑶姬。未行而亡，封于巫山之台。精魂为草，实曰灵芝”之说。
在我国家喻户晓的深化故事《白蛇传》中，女主人公白娘子只身前往娥眉山盗仙草，以救夫君许仙。历经艰辛、危险，终于感动了南极仙翁，取回了能“起死回生”的仙草灵芝。这一忠贞不渝的爱情故事被改编成小说、戏曲、电影、年画，在我国广为流传。
自古以来，灵芝是圣洁、美好的象征，故一些古代文学作品常以灵芝作为主题。
三国时代的诗人曹植写了许多有关灵芝的诗篇，在著名的《灵芝篇》中，称颂“灵芝生天地，朱草被洛滨，荣华相晃耀，光彩哗若神”，反映了诗人对灵芝的崇拜。
在《飞龙篇》中，则写到在云雾缭绕的泰山，遇到骑乘白鹿，手持灵芝的修炼者，并求养生之道的奇妙经历：“晨游泰山，云雾窈窕，忽逢二童， 颜色鲜好。乘彼白鹿，手翳芝草，我知真人，长跪问道。西登玉台，金楼复道，授我仙药，神皇所造。教我服食，还精补脑，寿同金石，永世难老。”
我国灵芝文化的发展受道家文化的影响最深。
葛洪在《抱朴子》中提出，“神仙可学而致”的仙学理论，并编纂了许多服食芝草而升仙的神话。
据葛洪《神仙记》记载麻姑修道于牟洲姑余山，姿容美妙，成仙后居蓬莱仙岛。农历三月三日王母寿辰，麻姑在绛珠河畔酿灵芝酒，敬献给王母做寿礼，后来民间多画此以贺寿。“麻姑献寿图”中仙女麻姑手捧灵芝酒，寿星举杯，仙童高举寿桃，仙鹤嘴衔灵芝，寓意“吉祥如意”、“福寿双全”。
受世界观和科学技术水平的限制，道教对灵芝的研究有局限性并带有迷信色彩。因此，道教宣扬的种芝、采芝、饵芝方法，也就带有神秘的宗教色彩。并因此招致古代医学者的批判，限制了古代灵芝的医药学研究和应用。
