首先，音色是个主观项目，契合所需的风格即刻，它本身不应该过多地作为优劣来评判。
演奏性能方面，长笛的核心优势一个是音域广度，另一个是音域内所有自然和变化音程在吹奏和链接时，音准音色的稳定性和指法的便利性高于竹笛，这些优势是通过相当复杂和完善的机械结构辅助实现的。而竹笛则因为结构相对简单，对音孔直接操控的细节更多，因此在各类装饰音，尤其是滑音的使用上有较大优势。那么反过来说就是他们的主要缺点了，长笛在演奏装饰音时，颗粒感较强，虽然可以实现一部分民乐技巧，但经常显得有些笨重死板，因为结构是半自动的，这些问题往往并不能通过技法来明显改善。而竹笛则在演奏变化音较多的曲目时，不仅难度较高，效果也不够理想。有些人认为高水平者可以克服这个问题，实际上由于叉指和半按的特性问题，无论怎么练，比起长笛来说，效果还是有明显差距。简而言之，长笛更为全面、稳定，而竹笛则是细节更丰富，只是程度差异，而非有无的差异，所以千万不要说“难道长笛细节不丰富吗”“难道竹笛吹不好变化音吗”这样的话。
硬件特性方面，长笛一般只需要一支乐器(使用中音笛低音笛之类另说)，而一支长笛的便携度低于一支竹笛。竹笛有时需要用到多支不同调性的乐器来适应音域和避免不必要的变化音，好不好带主要看一次带多少。维护方面，竹笛更多考虑管体防裂和笛膜修整，长笛则在机械维护和皮垫包养上需要多花心思。在价格上，正常情况下，不管一支长笛对应几支同档次的竹笛，都要更贵(你要对应100支那我告辞)。
适应风格上，长笛由于更为标准化，音色也为融合性作了改进，因此风格涉猎极为广泛，不仅在老本行的西方古典乐中如鱼得水，也广泛用于爵士乐、流行乐、新世纪等风格中，甚至有一部分民乐也是为长笛和西洋乐团创作的。而竹笛在专精特异化方面有较大成就，相应地就牺牲了泛用性，主要在中国新老民乐中大放异彩，在一些古风流行乐中也有很好地表现，但除此以外就几乎没有太主流的应用了。说到这儿，其实经常会看到一种观点认为长笛吹不了民乐，而竹笛可以胜任西洋乐，这是完全错误的观点，之所以会这么想，主要是因为他们只懂民乐却对西洋乐一无所知。实际上，直接跨风格演奏，无论是哪边效果都不太理想，不应强行为之。但是，确实有一些别出心裁的跨界值得探索，例如前面提到的为西洋乐创作的民族曲目，实际上早已广泛应用于一些古装影视配乐，梁祝更是其中的经典名作。而民乐演奏西洋乐曲则少有真正的高水平作品，大部分只能说是娱乐。不过实际上，随着音乐创作理论的发展，不论是东方还是西方音乐元素，都可以有机拆解和玩味，创作出不分所谓东西方的音乐，实际上早有大量这样的竹笛曲目，只是它们欣赏门槛较高，往往只在专业学术范围内受到喜爱和研究，难以进入普通大众的视线。
当然了，实际上不管哪个乐器，要深究下去还有很多东西，例如长笛有开闭键之分，前者一定程度上也有指肉微操的余地，而竹笛专业演奏者也有众多流派路线之分，他们玩的东西深度可是远超公园退休大爷的修身养性的。不过越是深入，越是难以直观对比，具体最好还是自己接触和学习来感悟吧。
以上
